<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Hi Lisa, Internet Archive, and Noisebridge,<br><br></div>Today, Signal and I got permission from our company, Invitae, to release an Open Source library of PubMed annotated content under the Apache License. <br><br></div><div>medgen-mysql:<br></div><div><br><div><a href="https://bitbucket.org/invitae/medgen-mysql">https://bitbucket.org/invitae/medgen-mysql</a><br></div><br>This library aggregates tons of annotations about medical genetics recently made available by the US National LIbrary of Medicine. We make these annotations available in MySQL databases.<br><br></div>We worked really hard to get this library open-sourced in time for the Aaron Swartz Hackathon this weekend, and also worked hard to smooth out the interface so that you can basically just do this:<br><br></div>make <database_name><br><br></div><div>...for databases like Clinvar, Pubmed, Gene, PersonalGenomes, and more.<br></div><div><br></div>We're hoping this library will catalyze some interesting explorative hacking in the spirit of downloading academic content for great justice.<br><br></div><div>Signal and I will both be on-hand tomorrow to explain the contents of these databases and suggest ways of using them.<br></div><div><br></div><div>See you tomorrow at the Internet Archive!<br></div><div><br></div>Much love,<br></div>Naomi<br><br><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Nov 2, 2014 at 10:55 AM, Lisa Rein <span dir="ltr"><<a href="mailto:lisa@lisarein.com" target="_blank">lisa@lisarein.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Noisebridge Folks :-)<br>
<br>
I wanted to make sure you all knew about the "Aaron Swartz Day and<br>
International Hackathon" events going on all over the world - and right<br>
here in San Francisco.<br>
<br>
First, on Saturday AND Sunday, at the beautiful Internet Archive (300<br>
Funston Ave, San Francisco) there's a hackathon going on from 11am-6pm.<br>
Food and Beverages will be provided and yes! there will be vegan options:<br>
<a href="http://www.aaronswartzday.org/sanfrancisco/" target="_blank">http://www.aaronswartzday.org/sanfrancisco/</a><br>
<br>
Then that night, a big celebration - with wine and goodies at 6pm (always<br>
vegan options), awesome speakers at 7pm, and a special screening, with<br>
Director Brian Knappenberger there in person, of "The Internet's Own Boy"<br>
at 8pm (*and* doing Q & A after the movie at 9:45).<br>
<br>
Speakers (7pm) include Dan Purcell from Aaron's legal team, Garrett<br>
Robinson and James Dolan from SecureDrop, Cindy Cohn from EFF, Kevin<br>
Poulsen re: FOIA case to have Aaron's FBI and Secret Service files<br>
released, and more. Here's the invite with all the speakers:<br>
<a href="http://www.aaronswartzday.org/invite/" target="_blank">http://www.aaronswartzday.org/invite/</a><br>
<br>
Finally, after the movie Q & A, keep the conversation going, and start<br>
planning your hackathon projects for Sunday, just a few blocks from the<br>
Internet Archive down Clement Street at Pizza Orgasmica (823 Clement St,<br>
San Francisco) where the afterparty will be going on from 10:30pm-1:30am.<br>
(Beer and pizza on the house, although we might start running out after<br>
the first 75 or so.)<br>
<br>
It is my hope that people will come from all around and bring their<br>
friends for the whole weekend extravaganza! I bet I can feed as many<br>
people as the Internet Archive upstairs can hold (300+). (Let's try to see<br>
how many people the Internet Archive can hold :-)<br>
<br>
Ok thanks for spreading the word. Getting people to think about this is as<br>
important as the event itself. I've created a page called "Setting the<br>
Record Straight" to help explain the facts of the case that everyone takes<br>
for granted right now, although the media still hasn't really chosen to<br>
clear up it's initial confusion. We'll see how it goes this time around.<br>
Maybe it will pay better attention:<br>
<a href="http://www.aaronswartzday.org/aaronswartzfacts/" target="_blank">http://www.aaronswartzday.org/aaronswartzfacts/</a><br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
lisa<br>
<br>
<br>
<br>
Lisa Rein<br>
<br>
<a href="http://www.aaronswartzday.org" target="_blank">http://www.aaronswartzday.org</a><br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Noisebridge-discuss mailing list<br>
<a href="mailto:Noisebridge-discuss@lists.noisebridge.net">Noisebridge-discuss@lists.noisebridge.net</a><br>
<a href="https://www.noisebridge.net/mailman/listinfo/noisebridge-discuss" target="_blank">https://www.noisebridge.net/mailman/listinfo/noisebridge-discuss</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Naomi Theora Most<br><a href="mailto:naomi@nthmost.com">naomi@nthmost.com</a><br>+1-415-728-7490<br><br>skype: nthmost<br><br><a href="http://twitter.com/nthmost">http://twitter.com/nthmost</a>
</div>